Наукове дослідження, проведене у Молдові та Україні, показало, що водні ресурси річки Дністер зменшуються через зміни клімату. Це пов’язано зі зростанням температури, перерозподілом опадів та тривалою маловодною фазою. Відтак, водозабезпечення регіону та екосистеми річки стають під загрозою. За останні десятиліття середня температура повітря зросла, а опади перерозподіляються таким чином, що літні та осінні опади зменшуються. Це може призвести до зимових паводків у верхній течії та літньої посухи в нижній частині басейну. Маловодна фаза водності спостерігається з 2011 року, що ускладнює водопостачання сільського господарства та загрожує екосистемам. Експерти радять впроваджувати водозберігаючі технології, модернізувати очисні споруди та співпрацювати між країнами для вирішення цієї проблеми.